与称义和成圣的教义密切相关的是善行的主题。由唯独因信称义的圣经教义的批评者提出的最普遍的异议之一是这样：“如果我们是唯独本乎恩、唯独藉着信，唯独因基督而得救，那么留给善行什么位置？”甚至使徒保罗也听到来自罗马基督徒的类似异议。“这样，怎么说呢？我们可以仍在罪中，叫恩典显多吗？（罗6:1）”

像这样的问题是由于担心如果太过强调上帝的恩典，基督徒将对上帝的事变得懒惰和漠不关心。恐怕基督徒可能太依赖恩典，而不会对善行表现出足够的热忱。毕竟，如果我们在神面前的地位取决于另外一位（耶稣基督）的善行，还有什么激励我们行出神在他话语中命令我们的那些行为呢？更糟糕的是，正如批评者所声称的，如果称义的教义是真的，并且在我们变成基督徒之后，我们是被称义的罪人，那么为什么要行出善行呢，因为这些仍然被我们的罪所污染？

保罗在罗马书6章中对这些问题的回答是明显的。针对强调恩典使得基督徒对其如何生活变冷漠的指责，保罗回应道，“断乎不可！”使徒的解释非常简单。“我们在罪上死了的人岂可仍在罪中活着呢？岂不知我们这受洗归入基督耶稣的人，是受洗归入他的死吗？所以我们藉着洗礼归入死，和他一同埋葬，原是叫我们一举一动有新生的样式，像基督藉着父的荣耀从死里复活一样”（罗6:2-4）。

在辩论罪人称义唯独因着信而不是因着行为（罗3:21-28）之后，使徒指出，那些藉着信心而称义的人也已经在罪上死了。基督徒不再渴望活在罪的辖制之下，因为他们已经与基督同埋葬并且随后复活成新的生命。唯独因信称义的教义非但没有摧毁行出善行的渴望，反而为善行建立基础。那些称义的（在罪上死了的）人，一举一动将有新生的样式，并且开始了成圣的过程。新生和我们的成圣的特征在于行善（参见弗2:10），以及有圣灵的果实（加5:16-26）。如保罗在其他地方所说，“我深信那在你们心里动了善工的，必成全这工，直到耶稣基督的日子”（腓1:6）。

因为这个问题成了这样的一个争议点，更正教信条和要理问答均在一定程度上论述了该问题。以在海德堡要理问答中的该讨论为例子。在指出善行是那些出于真正的信心、符合神的律法，并且是为上帝的荣耀而作的，而不是为了赚得奖赏（Q & A 91）之后，讨论十诫，着重于基督徒如何理解作为启示上帝意志的十诫（Q & A 92-114），然后要理问答接着讨论一个问题，就是即使当作为基督徒的我们不能完全遵守上帝的诫命的时候，为什么我们应当行善。在海德堡要理问答的114问中，问道，“那些归信神的人能否完全遵从这些诫命？”

在要理问答中114问给出的答案达到了唯独因信称义与善行之间关系的核心。“不能，即使是最圣洁的人，在遵守这些诫命方面，在此生也只是开展了一小步。然而，凭着郑重的决心，他们确实开始在生活中遵行所有神的诫命，而非当中的一部分。”

因为我们从头到脚都是罪恶的，并且因为罪在我们存有的每个方面都影响我们（参见弗4:17-24；罗3:9-20；诗51:1-5），即使被称义，我们仍然是罪恶的（加5:17；罗7:21-24）。甚至在我们当中那些得到很大信心的人，以及热切渴望过讨神喜悦的生活的人，也仍是罪人。我们的行为仍然被我们的罪恶所污染，以至于除了基督以外，这些行为将只是用作定我们的罪，因为这些行为被罪侵蚀，而且不是真正的善的。

既然我们“原是他的工作，在基督耶稣里造成的，为要叫我们行善，就是神所预备叫我们行的”（弗2:10），每个基督徒（唯独因信称义）将开始顺从神的诫命，然而，这顺从可能是犹豫的以及有瑕疵的。这是真的，不是因为在我们里面有回应神恩典的神圣火花，而是因为“你们立志行事，都是神在你们心里运行，为要成就他的美意”（腓2:13）。

因为完全如我们的称义一样，成圣也是上帝恩典的行动，所有已经唯独本乎恩、唯独藉着信、唯独因着基督而称义的人，将（如要理问答所说）按照神的诫命而活。因为我们的顺从（如同我们的罪）被基督的宝血和义所遮盖（甚至我们最差的善行也成为真正好的），我们的天父在我们软弱地努力行善中喜悦我们。而且知道这个实情，将在我们里面产生更加顺从的渴望。

---